Applied Biosystems QuantStudio 5
Система ПЦР в реальном времени (qPCR) на 96 лунок с 5 оптическими каналами. LED-оптическая система OptiFlex, нагрев до 3.66°C/с. Сенсорный интерфейс, облачная платформа Thermo Fisher Connect, совместимость с TaqMan и SYBR Green.
ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.
Ключевые характеристики
| Тип | Система ПЦР в реальном времени (qPCR) |
| Детектор | Фотодиод |
| Подключение | USB, Ethernet, Wi-Fi |
| Формат блока | 96 лунок x 0.2 мл (стандарт и Fast) |
| Быстрый режим | Да (Fast, ~40 мин на 40 циклов) |
| Скорость нагрева | До 3.66°C/с |
| Оптические каналы | 5 (возбуждение/эмиссия) |
| Диапазон красителей | FAM, SYBR, VIC, HEX, TAMRA, ROX, Cy5 |
| Равномерность блока | 0.5°C |
| Источник возбуждения | LED (5 шт.) |
| Точность температуры | 0.25°C |
| Программное обеспечение | QuantStudio Design and Analysis (QDAS) + Thermo Fisher Connect |
Описание
Назначение
Applied Biosystems QuantStudio 5 - система ПЦР в реальном времени (Real-Time PCR, qPCR) для количественного определения нуклеиновых кислот с флуоресцентной детекцией.
Место в линейке
QuantStudio 5 - средний уровень линейки qPCR Applied Biosystems. Младшие: QuantStudio 3 (4 канала, 96 лунок, базовый). Старшие: QuantStudio 7 Pro (блоки 96/384, 6 каналов, Fast режим), QuantStudio 12K Flex (384 + OpenArray). Для цифровой ПЦР - QuantStudio Absolute Q.
QuantStudio 5 - оптимальный выбор для лабораторий, которым нужно больше 4 каналов, но не требуется 384-луночный формат.
Принцип работы
qPCR совмещает амплификацию и детекцию в одном приборе. На каждом цикле ПЦР оптическая система возбуждает флуорофоры (TaqMan-зонды, SYBR Green, EvaGreen) и регистрирует эмиссию.
Флуоресценция пропорциональна количеству продукта ПЦР. Цикл, на котором флуоресценция пересекает пороговую линию (Ct / Cq), обратно пропорционален исходному количеству мишени: меньше Ct = больше исходных копий.
Позиция на рынке
QuantStudio 5 - один из самых популярных 96-луночных qPCR в мире. Applied Biosystems занимает крупнейшую долю рынка qPCR благодаря экосистеме TaqMan-эссе (>9 млн предразработанных зондов). Основные конкуренты: Bio-Rad CFX Opus 96, Roche LightCycler 480 II, Eppendorf Mastercycler ep realplex.
Ключевые технологии
OptiFlex - LED-оптическая система
5 светодиодов возбуждения и 5 фильтров эмиссии покрывают диапазон от FAM (520 нм) до Cy5/ROX (670 нм). LED-источники экономичнее и стабильнее галогенных ламп (нет деградации интенсивности со временем).
5 каналов позволяют мультиплексировать до 5 мишеней в одной лунке (например, патоген + внутренний контроль + ингибиционный контроль + два дополнительных маркёра).
Быстрый режим (Fast)
Блок 96-Fast поддерживает ускоренные протоколы: полный qPCR за ~40 минут вместо стандартных 90-120 минут. Совместим с Fast-реагентами (TaqMan Fast Advanced Master Mix).
Thermo Fisher Connect (облако)
Данные автоматически синхронизируются с облачной платформой. Удалённый доступ к результатам, совместная работа, резервное хранение. Встроенные аналитические модули: относительная количественная оценка (RQ), генотипирование SNP, анализ кривых плавления.
Автоматический ROX-нормализация
Пассивный референсный краситель ROX корректирует вариацию объёма между лунками. QuantStudio 5 поддерживает автоматическую нормализацию, что улучшает воспроизводимость многолуночных экспериментов.
Для кого подходит
- Генная экспрессия - количественная оценка мРНК (RT-qPCR) с нормализацией на референсные гены
- Молекулярная диагностика - детекция патогенов (SARS-CoV-2, грипп, туберкулёз) с TaqMan-зондами
- Генотипирование SNP - аллельная дискриминация (TaqMan SNP Genotyping Assays)
- Валидация NGS - подтверждение данных секвенирования количественным qPCR
- Пищевая безопасность - детекция ГМО, фальсификации мясной продукции, патогенов
- Ветеринарная диагностика - детекция вирусных и бактериальных патогенов животных
Особенности эксплуатации
Программное обеспечение
QuantStudio Design and Analysis Software (QDAS) - планирование эксперимента, сбор данных, анализ (Ct, кривые плавления, аллельная дискриминация, относительная/абсолютная количественная оценка). Локальное ПО + Thermo Fisher Connect (облако).
Требования к установке
- Форм-фактор: настольный
- Электропитание: 100-240 В
- Компьютер: Windows PC с ПО QDAS (или управление через планшет)
- Сеть: Ethernet/Wi-Fi для облачной синхронизации (опционально)
Обслуживание и расходные материалы
- Планшеты: MicroAmp (96-лунок, стандарт или Fast), оптические плёнки/крышки
- Реагенты: TaqMan Master Mix, SYBR Green Master Mix (расходные, не прибороспецифичные)
- Калибровка оптики: ежегодная (сервисный контракт Applied Biosystems)
- LED: ресурс >10 000 часов (замена крайне редка)
Обучение
Базовое: 1-2 дня (планирование эксперимента, настройка, анализ данных). Продвинутое: дизайн мультиплексных эссе, оптимизация, troubleshooting.
Ограничения
- Только 96-луночный формат (для 384 нужен QuantStudio 7 Pro)
- 5 каналов (для 6-плексных эссе нужен QuantStudio 7 Pro)
- Нет встроенного IVD (для диагностики нужны IVD-валидированные реагенты и протоколы)
- Облачная зависимость: часть функционала требует подключения к Thermo Fisher Connect
Области применения
Сравнение с аналогами
CFX Opus 96 - qPCR с оптоволоконной оптикой (одновременное считывание всех 96 лунок) и 6 оптическими каналами. QuantStudio 5 - 5 каналов с LED/фильтрами. CFX Opus имеет лучшую равномерность оптического считывания. QuantStudio 5 выигрывает экосистемой TaqMan (>9 млн эссе) и облачной платформой.
LightCycler 480 II - qPCR с ксеноновой лампой (широкий спектр возбуждения) и CCD-детектором. Доступен в форматах 96 и 384. Превосходит по скорости оптического считывания (все лунки одновременно). QuantStudio 5 - только 96 лунок, но LED-оптика стабильнее и дешевле в обслуживании (нет замены лампы).
QuantStudio 7 Pro - старшая модель с 6 каналами, сменными блоками (96/384), более быстрым термоциклированием и расширенными возможностями анализа. Для лабораторий с высокой загрузкой и потребностью в 384-луночном формате - 7 Pro. Для стандартных 96-луночных задач QuantStudio 5 - оптимальный баланс цена/функциональность.
Частые вопросы
Сколько мишеней можно мультиплексировать в одной лунке?
До 5, по числу оптических каналов. Типичная конфигурация: 3-4 мишени + 1 внутренний контроль (IC). Для 6-плексных эссе нужен QuantStudio 7 Pro (6 каналов). Мультиплексирование требует тщательного подбора красителей с минимальным спектральным перекрыванием.
Чем Fast-режим отличается от стандартного?
Fast-блок оптимизирован для тонкостенных планшетов MicroAmp Fast и ускоренных реагентов (TaqMan Fast Advanced). Полный qPCR (40 циклов) занимает ~40 минут vs 90-120 минут в стандартном режиме. Качество данных сопоставимо при использовании совместимых реагентов.
Нужно ли подключение к интернету для работы?
Нет, базовая работа (планирование, запуск, сбор данных, локальный анализ) выполняется офлайн через ПО QDAS. Интернет нужен для Thermo Fisher Connect (облачная синхронизация, совместная работа, продвинутые аналитические модули). Большинство лабораторий используют гибридный режим.
Дополнительные материалы
Коды для госзакупок
Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.
Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.
Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.