qPCR-системы Bio-Rad CFX
Линейка систем ПЦР в реальном времени Bio-Rad: CFX Opus 96 (5 каналов, 5 °C/с, Wi-Fi), CFX Opus 384 (4 канала, высокая пропускная способность), CFX Opus Deepwell (до 125 мкл). Технология Optical Shuttle - сканирование без пассивного красителя ROX. ПО CFX Maestro с поддержкой 21 CFR Part 11.
ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.
Ключевые характеристики
| ПО | CFX Maestro 2.3 (Security Edition - 21 CFR Part 11) |
| Вес | 22 кг |
| Тип | Системы ПЦР в реальном времени (qPCR) |
| Модели | CFX Opus 96, CFX Opus 384, CFX Opus Deepwell, CFX Opus 96/384 Dx (IVD) |
| Габариты | 33 x 56 x 36 см |
| Объём пробы | 1-50 мкл (96), 1-30 мкл (384), 1-125 мкл (Deepwell) |
| Мультиплекс | До 5 мишеней (96 лунок), до 4 мишеней (384 лунки) |
| Подключение | Wi-Fi, Ethernet, USB (Opus); USB (Touch) |
| Формат блока | 96 лунок / 384 лунки / 96 глубоких лунок |
| Производитель | Bio-Rad Laboratories, США |
| Диапазон эмиссии | 510-730 нм |
| Чувствительность | Детекция единичной копии в геномной ДНК человека |
| Оптическая система | Optical Shuttle (LED + фотодиоды, сканирование) |
| Равномерность блока | ±0,3 °C (Opus) / ±0,5 °C (Touch) |
| Диапазон возбуждения | 450-684 нм |
| Каналы флуоресценции | 5 + FRET (96 лунок), 4 + FRET (384 лунки) |
| Точность температуры | ±0,2 °C |
| Динамический диапазон | 10 порядков |
| Макс. скорость рампирования | 5 °C/с (96 лунок), 2,5 °C/с (384 лунки) |
Описание
Назначение
qPCR-системы Bio-Rad CFX - линейка приборов для количественной ПЦР в реальном времени (qPCR / RT-qPCR) от одного из крупныхмировых производителей молекулярно-биологического оборудования. CFX - старшая серия Bio-Rad для детекции и количественного определения нуклеиновых кислот.
Современная линейка CFX Opus - интегрированные автономные системы (термоциклер + оптика в одном корпусе). Предыдущее поколение CFX96/CFX384 Touch было модульным - оптический модуль устанавливался на базу C1000 Touch.
Обзор линейки
| Модель | Формат | Каналы | Мультиплекс | Скорость | Объём пробы | Для кого |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CFX Opus 96 | 96 лунок | 5 + FRET | До 5 мишеней | 5 °C/с | 1-50 мкл | Исследовательские лаборатории |
| CFX Opus 384 | 384 лунки | 4 + FRET | До 4 мишеней | 2,5 °C/с | 1-30 мкл | Высокая пропускная способность |
| CFX Opus Deepwell | 96 лунок (глубокие) | 5 + FRET | До 5 мишеней | 2,5 °C/с | 1-125 мкл | Большие объёмы реакций |
| CFX Opus 96 Dx | 96 лунок | 5 + FRET | До 5 мишеней | 5 °C/с | 1-50 мкл | Клиническая диагностика (IVD) |
| CFX Opus 384 Dx | 384 лунки | 4 + FRET | До 4 мишеней | 2,5 °C/с | 1-30 мкл | Клиническая диагностика (IVD) |
| CFX96 Touch* | 96 лунок | 5 + FRET | До 5 мишеней | 5 °C/с | 1-50 мкл | Устаревшая, модульная |
| CFX384 Touch* | 384 лунки | 4 + FRET | До 4 мишеней | 2,5 °C/с | 1-30 мкл | Устаревшая, модульная |
*CFX96 Touch и CFX384 Touch снимаются с производства, заменяются линейкой CFX Opus.
Принцип работы
qPCR-система объединяет термоциклер (циклическое изменение температуры для ПЦР) и оптическую систему детекции (измерение флуоресценции после каждого цикла). Нарастание флуоресцентного сигнала пропорционально количеству амплифицированной ДНК.
Фирменная технология Bio-Rad - Optical Shuttle: механический сканер с LED-источниками и фотодиодами перемещается над планшетом, центрируясь над каждой лункой индивидуально. Это устраняет оптические перекрёстные помехи и не требует пассивного референсного красителя (ROX).
Позиция на рынке
Bio-Rad CFX - один из трёх крупныхбрендов qPCR (вместе с Applied Biosystems QuantStudio и Roche LightCycler). Конкурентные преимущества: технология Optical Shuttle (не требует ROX), открытая платформа для IVD (Dx-версии), простота использования (без калибровки оптики).
Ключевые технологии
Optical Shuttle - оптический сканер
Главная отличительная технология всех систем CFX. Механический челнок с LED-источниками возбуждения и фильтрованными фотодиодами физически перемещается по поверхности планшета. Для каждой лунки челнок останавливается точно по центру, обеспечивая:
- Одинаковый оптический путь для каждой лунки (нет краевых эффектов)
- Отсутствие оптических перекрёстных помех между лунками
- Не требуется калибровка оптической системы
- Не требуется пассивный референсный краситель ROX
Полное сканирование 96-луночного планшета - 12 секунд (все каналы) или 3 секунды (один канал FAM/SYBR).
Honeycomb Thermoblock (CFX Opus)
Новая архитектура термоблока в линейке Opus - сотовая структура для улучшенного распределения тепла. Равномерность температуры ±0,3 °C (улучшение по сравнению с ±0,5 °C у CFX96 Touch).
5 каналов флуоресценции + FRET
Оптическая система CFX Opus 96 включает 6 LED-источников и 6 фотодиодов:
| Канал | Возбуждение | Эмиссия | Совместимые красители |
|---|---|---|---|
| 1 | ~450 нм | ~510-530 нм | FAM, SYBR Green, EvaGreen |
| 2 | ~500 нм | ~560-580 нм | HEX, VIC, JOE |
| 3 | ~560 нм | ~610-650 нм | Texas Red, ROX |
| 4 | ~620 нм | ~675-690 нм | Cy5 |
| 5 | ~650 нм | ~705-730 нм | Quasar 705, Cy5.5 |
| FRET | - | - | Специальный канал |
CFX Opus 384 имеет 5 LED/5 фотодиодов (4 канала + FRET).
CFX Maestro - программное обеспечение
Единое ПО для всех систем CFX (текущая версия 2.3). Возможности:
- Анализ экспрессии генов (относительная количественная оценка)
- Анализ числа копий (CNV)
- Генотипирование / SNP-дискриминация
- High Resolution Melt (HRM) анализ
- Аллельная дискриминация
- Security Edition: 21 CFR Part 11 (аудит-трейл, электронные подписи, шифрование)
Облачная платформа BR.io
CFX Opus поддерживает подключение к облаку BR.io через Wi-Fi или Ethernet. Удалённый мониторинг запусков, облачное хранение данных, доступ к протоколам с любого устройства.
Для кого подходит
- Исследовательские лаборатории - CFX Opus 96: 5 каналов мультиплекса, Wi-Fi, ПО CFX Maestro
- Высокопроизводительные лаборатории - CFX Opus 384: 384 лунки, скрининг, валидация массивов
- Клинические/диагностические лаборатории - CFX Opus Dx: IVD-сертификация (FDA, CE-IVD), 21 CFR Part 11
- Работа с большими объёмами - CFX Opus Deepwell: до 125 мкл (нестандартные протоколы, Digital PCR prep)
- Лаборатории с qPCR и обычной ПЦР - CFX96 Touch (пока доступен): модульная база C1000 Touch используется и для обычной ПЦР
- Анализ экспрессии генов - все модели: RT-qPCR с SsoAdvanced/iTaq реагентами
- Детекция патогенов - CFX Opus Dx: открытая платформа для любых IVD-наборов
- Количественная оценка библиотек NGS - CFX Opus 96: qPCR-квантификация перед секвенированием
Особенности эксплуатации
Как выбрать модель
Формат планшета:
- 96 лунок (стандарт) -> CFX Opus 96
- 384 лунки (высокая пропускная способность) -> CFX Opus 384
- 96 глубоких лунок (большой объём) -> CFX Opus Deepwell
Нужна ли IVD-сертификация?
- Да -> CFX Opus 96 Dx или CFX Opus 384 Dx
- Нет -> стандартные версии
Нужна ли модульность (C1000 Touch + обычная ПЦР)?
- Да -> CFX96 Touch (пока доступен)
- Нет -> CFX Opus (автономная, лучшие характеристики)
Сколько мишеней в мультиплексе?
- До 5 -> CFX Opus 96 / Deepwell (5 каналов)
- До 4 -> CFX Opus 384 (4 канала)
Расходные материалы
- Планшеты: Hard-Shell 96-Well PCR Plates (тонкостенные, белые, для подходящего считывания)
- Плёнки: Microseal 'B' Adhesive Seals или Microseal 'C' Film
- Реагенты (SYBR): SsoAdvanced Universal SYBR Green Supermix, SsoFast EvaGreen Supermix
- Реагенты (зонды): SsoAdvanced Universal Probes Supermix, iTaq Universal Probes Supermix
Bio-Rad рекомендует белые планшеты для максимального флуоресцентного сигнала.
Переход с CFX96 Touch на CFX Opus 96
Bio-Rad опубликовал данные Bland-Altman, демонстрирующие эквивалентность платформ: результаты, полученные на CFX96 Touch и CFX Opus 96, сопоставимы. Перевалидация протоколов при переходе обычно не требуется.
Обслуживание
CFX Opus не требует калибровки оптической системы (калибровка-free дизайн). Рекомендуется ежегодная профилактика термоблока. Нет расходных оптических элементов.
Ограничения
- CFX Opus 384 имеет только 4 канала (vs 5 у 96-луночных моделей)
- CFX Opus - автономная система, нельзя использовать как обычный термоциклер без оптики
- Максимум 5 мишеней в мультиплексе (QuantStudio поддерживает до 6)
- CFX96 Touch снимается с производства - модульная концепция уходит
- Нет VeriFlex-аналога (независимые температурные зоны)
Области применения
Сравнение с аналогами
QuantStudio 5 предлагает 6 каналов (vs 5 у CFX Opus 96) и скорость рампирования 6 °C/с (vs 5 °C/с). CFX Opus имеет технологией Optical Shuttle (не требует ROX), калибровка-free оптикой и облачной платформой BR.io. QuantStudio теснее интегрирован с экосистемой TaqMan (зонды, наборы). CFX - более открытая платформа.
LightCycler 480 II имеет серебряный термоблок (высокая равномерность) и ксеноновую лампу (широкий спектр возбуждения). CFX Opus предлагает более современные LED-источники (дольше служат, стабильнее), Wi-Fi/облако и не требует калибровки. LightCycler 480 II - зрелая платформа с сильными позициями в клинике и фарминдустрии, особенно для HRM-анализа.
QuantStudio 7 Pro - премиальная платформа со сменными блоками (96/384/TaqMan Array Cards), 6 каналами и технологией VeriFlex (независимые температурные зоны). CFX Opus проще в использовании (Optical Shuttle без калибровки), дешевле и не требует ROX. QS7 Pro обладает гибкостью формата, количеством каналов и интеграцией с экосистемой Thermo Fisher.
Частые вопросы
Чем CFX Opus 96 отличается от CFX96 Touch?
CFX Opus 96 - автономная интегрированная система (термоциклер + оптика в одном корпусе). CFX96 Touch - модульная система (оптический модуль + база C1000 Touch). Opus имеет сотовый термоблок (±0,3 °C vs ±0,5 °C), Wi-Fi, облачную платформу BR.io и улучшенный сенсорный экран. Оптическая производительность эквивалентна (подтверждено анализом Bland-Altman). CFX96 Touch снимается с производства.
Почему CFX не требует пассивного красителя ROX?
Технология Optical Shuttle: оптический сканер физически перемещается над планшетом и центрируется точно над каждой лункой. Это даёт одинаковый оптический путь для всех лунок и устраняет краевые эффекты. Конкуренты с фиксированной оптикой (CCD/CMOS-камеры) используют ROX для нормализации межлуночных различий в освещении. CFX не нуждается в этой компенсации.
Можно ли использовать CFX Opus как обычный термоциклер (без qPCR)?
Нет. CFX Opus - интегрированная система, в которой оптика неотделима от термоциклера. Для обычной ПЦР Bio-Rad предлагает отдельные термоциклеры T100 и PTC Tempo. Ранее CFX96 Touch был модульным: оптический модуль снимался, и C1000 Touch работал как обычный термоциклер.
Какую модель выбрать для клинической диагностики?
CFX Opus 96 Dx или CFX Opus 384 Dx. Версии Dx имеют IVD-сертификацию (FDA, CE-IVD) и поставляются с CFX Maestro Dx SE (Security Edition) для соответствия 21 CFR Part 11 (аудит-трейл, электронные подписи, шифрование данных). CFX - открытая платформа: работает с любыми коммерческими IVD-наборами, не привязана к экосистеме одного производителя.
Сколько каналов и мишеней можно детектировать одновременно?
CFX Opus 96 и Deepwell: 5 каналов + FRET, до 5 мишеней на лунку. CFX Opus 384: 4 канала + FRET, до 4 мишеней на лунку. Каналы: FAM/SYBR (1), HEX/VIC (2), Texas Red/ROX (3), Cy5 (4), Quasar 705 (5). Для большинства задач 3-4 канала достаточно; 5-канальный мультиплекс используется в сложных диагностических панелях.
Дополнительные материалы
Коды для госзакупок
Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.
Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.
Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.