MGI DNBSEQ-E25
Компактный настольный секвенатор начального уровня на технологии DNBSEQ (DNA Nanoballs + cPAS). Выход до 7,5 Гб за запуск, до 50 млн ридов, длина до PE150. Ориентирован на малые лаборатории, таргетное секвенирование и быстрые прогоны.
ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.
Ключевые характеристики
| Тип | Настольный секвенатор начального уровня |
| Форм-фактор | Компактный настольный |
| Время запуска | 12-29 ч (в зависимости от режима) |
| Формат данных | FASTQ |
| Длина ридов (макс) | PE150 |
| Парный конец (paired-end) | Да |
| Точность чтения (Q30+) | 85%+ |
| Мультиплексирование | Да (стандартные индексы MGI) |
| Проточные ячейки/чипы | Секвенаторный чип E25 (1 слот) |
| Выход данных за запуск | До 7,5 Гб |
| Программное обеспечение | MegaBOLT, ZTRON |
| Количество ридов за запуск | До 50 млн |
| Технология секвенирования | DNBSEQ (DNA Nanoballs + cPAS) |
Описание
Назначение
MGI DNBSEQ-E25 представляет собой компактный настольный секвенатор начального уровня. Прибор разработан для небольших лабораторий, которым требуется локальное секвенирование без зависимости от крупных секвенаторных центров.
Место в линейке
DNBSEQ-E25 занимает позицию самого доступного секвенатора в портфеле MGI. Следующая ступень, DNBSEQ-G99, предлагает более высокий выход данных и гибкость конфигураций. Для средних и крупных проектов предназначены DNBSEQ-G400 и продакшн-системы DNBSEQ-T7 и DNBSEQ-T20x2.
В сравнении с Illumina iSeq 100, прибор обеспечивает значительно больший выход данных (7,5 Гб против 1,2 Гб) при сопоставимом форм-факторе. Стоимость секвенирования на гигабайт у E25 ниже за счёт более эффективной технологии ДНК-наношаров.
Принцип работы
Технология DNBSEQ объединяет два ключевых этапа. На первом этапе из линейных библиотек формируются кольцевые молекулы, которые амплифицируются методом катящегося кольца (Rolling Circle Amplification, RCA) в компактные ДНК-наношары (DNA Nanoballs, DNB). На втором этапе наношары загружаются на паттернированный чип с регулярной решёткой связывающих сайтов.
Считывание последовательности выполняется методом cPAS (combinatorial Probe-Anchor Synthesis). Флуоресцентно меченые зонды гибридизуются с якорным праймером, и сигнал регистрируется камерой. В отличие от мостиковой амплификации Illumina, наношары не требуют кластерогенеза на проточной ячейке, что снижает дупликацию и ошибки.
Позиция на рынке
E25 ориентирован на клиники и малые исследовательские группы, где объём секвенирования не превышает нескольких запусков в неделю. Типичные задачи: таргетные панели, секвенирование ампликонов, верификация вариантов и микробиомные исследования на основе 16S.
Компактный форм-фактор и минимальные требования к инфраструктуре делают E25 удобным инструментом для точки входа в NGS. Прибор также подходит как дополнительная система в крупных лабораториях для срочных и малообъёмных задач.
Области применения
Сравнение с аналогами
iSeq 100 генерирует до 1,2 Гб за запуск (до 4 млн ридов), что в 6 раз меньше E25. Оба прибора компактны и не требуют специальной инфраструктуры. iSeq 100 использует CMOS-сенсор и одноразовые картриджи, что упрощает рабочий процесс, но ограничивает гибкость. E25 предлагает значительно лучшее соотношение стоимости за гигабайт.
MiSeq обеспечивает до 15 Гб (PE300) и до 25 млн ридов, превосходя E25 по выходу и максимальной длине ридов. MiSeq остаётся стандартом для ампликонного секвенирования и малых геномов благодаря длинным ридам (2x300 bp). E25 компактнее и дешевле в эксплуатации, но ограничен длиной PE150.
DNBSEQ-G99, следующая модель в линейке MGI, предлагает до 72 Гб за запуск и до 480 млн ридов. G99 поддерживает несколько типов проточных ячеек, что обеспечивает гибкость масштабирования. E25 выгоднее при стабильно малых объёмах секвенирования, где избыточная мощность G99 не востребована.
Частые вопросы
Чем DNBSEQ-E25 отличается от Illumina iSeq 100?
Оба прибора занимают нишу компактных настольных секвенаторов, но E25 существенно превосходит iSeq 100 по выходу данных: до 7,5 Гб против 1,2 Гб. Технология ДНК-наношаров обеспечивает более низкий уровень дупликации ридов по сравнению с мостиковой амплификацией. Стоимость секвенирования на мегабазу у E25 также ниже.
Подходит ли E25 для секвенирования полного генома человека?
Технически прибор способен генерировать данные WGS, но выход 7,5 Гб за запуск недостаточен для клинически значимого покрытия (30x требует около 90 Гб). E25 оптимален для таргетного секвенирования, малых геномов и ампликонных библиотек. Для WGS человека рекомендуются DNBSEQ-G400, DNBSEQ-T7 или DNBSEQ-T20x2.
Какие расходные материалы необходимы для работы?
Для каждого запуска требуются секвенаторный чип E25 и набор реагентов (секвенирующий кит). Библиотеки готовятся с помощью стандартных наборов MGI для подготовки библиотек и формирования ДНК-наношаров (DNB Making Kit). Все расходные материалы поставляются как готовые к использованию наборы.
Дополнительные материалы
Коды для госзакупок
Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.
Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.
Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.