Applied Biosystems QuantStudio Absolute Q
Микрофлюидная система цифровой ПЦР. Образец разделяется на 20 480 микрокамер в чипе MAP16 (16 реакций на чип). 5 флуоресцентных каналов. Полный цикл за 90 минут. Интегрированный прибор: разделение, термоциклирование и считывание в одном.
ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.
Ключевые характеристики
| Тип | Микрофлюидная цифровая ПЦР |
| Детекция | Imaging (5 каналов) |
| Интеграция | Разделение + термоциклирование + считывание в одном приборе |
| Подключение | USB, Ethernet, Wi-Fi |
| Объём образца | 9 мкл на камеру |
| Объём раздела | ~0.4 нл |
| Камер на планшет | 16 (MAP16) |
| Время полного цикла | 90 мин (разделение + ПЦР + считывание) |
| Количество разделов | 20 480 на камеру |
| Динамический диапазон | 0.1-14 000 копий/мкл |
| Флуоресцентные каналы | 5 (FAM, VIC/HEX, ABY/TAMRA, JUN/ROX, Cy5) |
| Программное обеспечение | QuantStudio Absolute Q dPCR Software + Connect |
Описание
Назначение
Applied Biosystems QuantStudio Absolute Q - компактная система цифровой ПЦР, объединяющая все этапы workflow (разделение образца, амплификация, считывание) в одном настольном приборе.
Место в линейке
Absolute Q - единственная система цифровой ПЦР в портфеле Applied Biosystems (Thermo Fisher). Дополняет линейку QuantStudio (qPCR) возможностями абсолютной количественной оценки.
Thermo Fisher приобрёл технологию Combinati (стартап, микрофлюидная dPCR на чипах) и интегрировал её в экосистему QuantStudio.
Принцип работы
Образец с реагентами загружается в MAP16 plate - микрофлюидный планшет с 16 независимыми камерами. Каждая камера содержит сеть микроканалов, разделяющих образец на 20 480 изолированных разделов (микрокамер).
Прибор Absolute Q выполняет все этапы автоматически:
- Заполнение микрокамер (разделение)
- Термоциклирование (встроенный Пельтье)
- Флуоресцентное считывание (imaging, 5 каналов)
Полный цикл - 90 минут от загрузки до результата.
Позиция на рынке
Absolute Q - самая быстрая dPCR-система на рынке (90 мин vs 3-4 ч у конкурентов). Интегрированный формат и экосистема Thermo Fisher делают её привлекательной для лабораторий, уже использующих QuantStudio qPCR. Основные конкуренты: Bio-Rad QX200/QX600, Stilla Naica.
Ключевые технологии
Микрофлюидный чип MAP16
16 независимых камер на планшете. Каждая камера: 20 480 микроразделов. Итого: 16 x 20 480 = 327 680 разделов на один планшет.
Объём образца: 9 мкл на камеру. Объём раздела: ~0.4 нл. Разделение пассивное (капиллярные силы), без масла для эмульсификации.
5 флуоресцентных каналов
FAM, VIC/HEX, ABY/TAMRA, JUN/ROX, Cy5. 5 каналов позволяют нативный 5-плексный анализ - больше, чем у QX200 (2) и Naica (3), сопоставимо с QX600 (6).
Для мультиплексирования можно использовать стандартные TaqMan-зонды Applied Biosystems.
Интегрированный workflow
Один прибор = разделение + ПЦР + считывание. Нет отдельного генератора (QX200), нет переноса капель, нет отдельного ридера. Оператор загружает MAP16 и получает результат через 90 минут.
Быстрый термоциклер
Встроенный Пельтье с ускоренным рэмпингом. 40 циклов ПЦР за 55 минут (vs 90-120 мин у стандартных термоциклеров). В сумме с разделением (10 мин) и считыванием (~25 мин) - 90 минут полный цикл.
Для кого подходит
- Клинические лаборатории - быстрый результат (90 мин), 5-плексные панели, интегрированный workflow
- Жидкостная биопсия - детекция ctDNA, мониторинг MRD
- Количественная оценка NGS-библиотек - точная загрузка секвенаторов
- Генная терапия - количественная оценка вирусных векторов (AAV, лентивирус)
- Валидация qPCR-данных - перекрёстная проверка результатов QuantStudio qPCR
- Пищевая безопасность - абсолютная количественная оценка ГМО-событий
Особенности эксплуатации
Программное обеспечение
QuantStudio Absolute Q Digital PCR Software - планирование, сбор данных, анализ. 2D scatter plots, автоматические пороги, расчёт концентрации. Интеграция с Thermo Fisher Connect (облачная аналитика).
Рабочий процесс
- Подготовка смеси (образец + мастер-микс + зонды)
- Загрузка в MAP16 планшет (пипетирование, 5 мин)
- Установка в прибор: всё автоматически
- Результат через 90 минут
Требования к установке
- Один настольный прибор (компактный)
- Компьютер: Windows PC или планшет
- Электропитание: 100-240 В
Обслуживание и расходные материалы
- MAP16 plates: ~$8-12 за камеру
- Мастер-микс: Absolute Q Digital PCR Master Mix (оптимизирован для платформы)
- Калибровка: ежегодная
Обучение
Минимальное: 1 день. Workflow интуитивен: загрузил - получил результат.
Ограничения
- 16 камер на планшет (vs 96 лунок у QX200): пропускная способность для больших серий ниже
- Объём образца 9 мкл (vs 20 мкл у QX200): меньше копий мишени загружается
- 20 480 разделов (vs 20 000 у QX200, 25 000 у Naica): сопоставимо
- Новая платформа (с 2020 г.): меньше публикаций, чем у QX200
- Зависимость от MAP16 планшетов (единственный формат)
Области применения
Сравнение с аналогами
QX200 - капельная ddPCR с 2 каналами, 96-луночный формат. Выше пропускная способность (96 лунок vs 16 камер). Крупнейшая установленная база (>5000 публикаций). Absolute Q выигрывает скоростью (90 мин vs 3-4 часа), интегрированным workflow (один прибор) и 5 каналами (vs 2). QX200 дешевле в расходных.
Naica - кристальная dPCR с 3 каналами. Также герметичный чип, но раздельные приборы (Geode + Prism3). Absolute Q - один прибор, 5 каналов, быстрее (90 мин vs ~3 часа). Naica - 25 000 разделов (vs 20 480), чуть больший объём образца (25 vs 9 мкл). Absolute Q интегрированнее и более мультиплексный.
QX600 - ddPCR с 6 каналами, автоматизированный генератор, 96-луночный формат. Превосходит Absolute Q по пропускной способности и на 1 канал больше. Absolute Q выигрывает скоростью (90 мин), компактностью (один прибор) и интеграцией с экосистемой QuantStudio. QX600 - для крупных лабораторий, Absolute Q - для быстрых ответов.
Частые вопросы
Почему Absolute Q такой быстрый (90 мин vs 3-4 часа)?
Три причины: (1) пассивное разделение в микрокамерах (~10 мин vs 30 мин генерация капель), (2) ускоренный термоциклер (~55 мин на 40 циклов), (3) интегрированное считывание (нет переноса в отдельный ридер). У QX200 основное время тратится на ручной перенос капель и последовательное считывание каплеридером (1-2 мин/лунка x 96 = 2 часа).
Совместимы ли TaqMan-зонды Applied Biosystems?
Да. Absolute Q использует стандартные TaqMan-зонды (FAM/VIC/ABY/JUN/Cy5). Лаборатории, работающие на QuantStudio qPCR, могут использовать те же зонды и праймеры для dPCR без перепроектирования эссе. Мастер-микс специфичный (Absolute Q Digital PCR Master Mix).
Для каких задач 90 минут критично?
Жидкостная биопсия в клинике: быстрый ответ для принятия решения о терапии. Количественная оценка NGS-библиотек: секвенатор ждёт загрузки. QC при производстве генной терапии: партия вирусных векторов должна быть оценена до выпуска. В исследовательских лабораториях скорость менее критична.
Дополнительные материалы
Коды для госзакупок
Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.
Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.
Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.