Agilent TapeStation 4200
Автоматизированная система капиллярного электрофореза для контроля качества ДНК, РНК и белков. Анализирует до 96 образцов без участия оператора с использованием готовых картриджей ScreenTape. Генерирует виртуальный гель, электрофореграмму и количественные параметры (RIN, DV200, размер, концентрация).
ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.
Ключевые характеристики
| Тип | Автоматизированная система капиллярного электрофореза |
| Масса | ~30 кг |
| Аналиты | ДНК, РНК, белки |
| Детекция | Лазер-индуцированная флуоресценция (LIF) |
| Форм-фактор | Настольный |
| Производитель | Agilent Technologies, США |
| Время на образец | 1-2 минуты |
| Чувствительность | от 5 пг/мкл (High Sensitivity) |
| Максимум образцов | 96 (без участия оператора) |
| Расходные материалы | ScreenTape (16 анализов/картридж) |
| Диапазон размеров ДНК | 35-60000 п.н. (зависит от типа ScreenTape) |
| Количественные метрики | RIN, DIN, DV200, концентрация, молярность |
| Программное обеспечение | TapeStation Controller / Analysis Software |
| Диапазон размеров белков | 14-200 кДа |
Описание
Назначение
Agilent TapeStation 4200 - автоматизированная платформа капиллярного электрофореза для количественного и качественного анализа нуклеиновых кислот и белков. Прибор заменяет ручной гель-электрофорез для задач контроля качества, обеспечивая стандартизированные, воспроизводимые результаты без субъективной оценки.
Место в линейке
TapeStation 4200 - старшая модель с загрузкой до 96 образцов. TapeStation 4150 анализирует до 16 образцов и ориентирована на лаборатории с меньшей нагрузкой. Bioanalyzer 2100 - предыдущее поколение капиллярного электрофореза Agilent с чипами LabChip.
TapeStation 4200 подходит для NGS-лабораторий и core facilities с высокой пропускной способностью, где требуется автоматизация QC-этапа.
Принцип работы
Образцы загружаются в стандартные пробирки (strip tubes, 8 штук) или 96-луночные планшеты. Прибор автоматически отбирает аликвоту, смешивает с буфером и загружает в капилляр картриджа ScreenTape. Под действием электрического поля молекулы разделяются по размеру.
Детекция осуществляется лазер-индуцированной флуоресценцией (LIF). Результат - электрофореграмма (пики = фрагменты определённого размера) и виртуальный гель (цифровая реконструкция традиционного геля).
Позиция на рынке
TapeStation - стандарт QC в NGS-лабораториях для проверки библиотек перед секвенированием. Установленная база исчисляется тысячами приборов в геномных центрах, фармацевтических компаниях и академических лабораториях. Agilent предоставляет сертификаты качества ScreenTape для валидированных workflow.
Ключевые технологии
ScreenTape - готовые картриджи
ScreenTape - предзалитый картридж с капилляром, гелевой матрицей и буферами. Каждый картридж рассчитан на 16 анализов. Картриджи хранятся при комнатной температуре и имеют срок годности до 6 месяцев.
Доступные типы ScreenTape:
| Тип | Аналит | Диапазон | Чувствительность |
|---|---|---|---|
| D1000 | ДНК 35-1000 п.н. | 0.1-50 нг/мкл | NGS-библиотеки |
| D5000 | ДНК 100-5000 п.н. | 0.1-50 нг/мкл | Фрагментация |
| Genomic DNA | Геномная ДНК | До 60000 п.н. | DIN оценка |
| High Sensitivity D5000 | ДНК 100-5000 п.н. | 5-1000 пг/мкл | Низкие концентрации |
| RNA | Тотальная РНК | 25-6000 нт | RIN оценка |
| High Sensitivity RNA | РНК | 500 пг-10 нг/мкл | Низкий input |
| Protein | Белки 14-200 кДа | 20 нг-2 мкг | SDS-PAGE замена |
Автоматизация загрузки
Робот-манипулятор TapeStation 4200 обрабатывает до 96 образцов без вмешательства оператора. Образцы загружаются в strip tubes (8 шт.) или 96-луночный планшет. Прибор автоматически дозирует буфер, перемешивает, денатурирует (для РНК) и загружает в капилляр.
Время анализа: 1-2 минуты на образец. Полный 96-луночный планшет обрабатывается за 2-3 часа.
Количественные метрики
TapeStation автоматически рассчитывает:
- RIN (RNA Integrity Number) - оценка целостности РНК от 1 (деградированная) до 10 (интактная)
- DIN (DNA Integrity Number) - аналогичная метрика для геномной ДНК
- DV200 - доля фрагментов РНК длиннее 200 нт (важно для FFPE-образцов)
- Концентрация (нг/мкл, нмоль/л для библиотек)
- Средний размер фрагментов (п.н.)
- Молярность (для расчёта загрузки на секвенатор)
Интеграция с NGS-workflow
TapeStation Controller Software генерирует отчёты, совместимые с LIMS и ПО планирования загрузки секвенаторов. Молярность библиотек рассчитывается автоматически для нормализации перед пулированием.
Для кого подходит
- NGS-лаборатории - QC библиотек перед загрузкой на секвенатор (Illumina, PacBio, ONT)
- Core facilities - централизованный QC нуклеиновых кислот для множества исследовательских групп
- Молекулярная диагностика - оценка качества РНК из FFPE-образцов (DV200)
- Биобанки - контроль целостности ДНК/РНК при длительном хранении (DIN, RIN)
- Фармацевтическая разработка - QC мРНК-вакцин и генотерапевтических препаратов
- Протеомика - контроль белковых фракций перед масс-спектрометрией
Особенности эксплуатации
Программное обеспечение
TapeStation Controller Software - управление прибором и сбор данных. TapeStation Analysis Software - обработка результатов, построение виртуальных гелей, расчёт RIN/DIN/DV200, генерация отчётов. Экспорт в PDF, CSV, XML.
Интеграция с Agilent 2200 TapeStation Software для ретроспективного анализа данных.
Требования к установке
- Форм-фактор: настольный
- Масса: около 30 кг
- Электропитание: 100-240 В, 50/60 Гц
- Подключение: USB или Ethernet к ПК
- Температура помещения: 18-28°C
- Ровная поверхность без вибраций
Обслуживание и расходные материалы
- ScreenTape картриджи (16 анализов/картридж, хранение при комнатной температуре)
- Буферы и реагенты (зависят от типа ScreenTape)
- Strip tubes или 96-луночные планшеты
- Капиллярная промывка каждые 500 анализов
- Ежегодное профилактическое обслуживание
Обучение
Базовое освоение: 1 день. Прибор максимально автоматизирован - оператор загружает образцы и запускает протокол. Интерпретация результатов (RIN, виртуальный гель) требует базового понимания электрофореза.
Ограничения
- Не подходит для препаративного выделения (только аналитика)
- Диапазон размеров ограничен типом ScreenTape (нет универсального картриджа для всех размеров)
- Стоимость за анализ выше, чем у ручного гель-электрофореза
- Не заменяет полноценную систему Bioanalyzer для задач, требующих чиповой технологии
Области применения
Сравнение с аналогами
Bioanalyzer 2100 - предыдущее поколение капиллярного электрофореза Agilent на основе микрочипов LabChip. Каждый чип анализирует 11 образцов. Bioanalyzer даёт несколько более высокое разрешение для коротких фрагментов ДНК. TapeStation 4200 имеет больше по автоматизации (96 образцов vs 11), удобству (ScreenTape проще чипов) и стоимости за анализ. Bioanalyzer предпочтителен для задач, требующих максимального разрешения в узком диапазоне.
Fragment Analyzer (ранее Advanced Analytical) - система параллельного капиллярного электрофореза с 12 или 96 капиллярами. Анализирует весь планшет одновременно, а не последовательно. Превосходит TapeStation 4200 по скорости для 96 образцов (30-60 мин vs 2-3 часа). TapeStation 4200 проще в обслуживании (ScreenTape vs капилляры), компактнее и доступнее. Fragment Analyzer предпочтителен для крупных геномных центров с нагрузкой 1000+ образцов в неделю.
Bio-Rad Mini-PROTEAN Tetra - система классического вертикального электрофореза. Не является автоматизированной, требует ручной подготовки гелей и визуальной оценки результатов. Подходит для препаративных задач и Western blot. TapeStation 4200 даёт количественный результат, автоматизацию и стандартизацию, но не подходит для препаративных целей. Приборы решают разные задачи и дополняют друг друга.
Частые вопросы
Чем TapeStation 4200 отличается от 4150?
Основное отличие - пропускная способность. TapeStation 4200 обрабатывает до 96 образцов в одном прогоне (96-луночный планшет), 4150 - до 16 образцов (strip tubes). Оптика и картриджи ScreenTape идентичны, качество анализа одинаковое. 4200 предназначен для core facilities и высоконагруженных лабораторий. 4150 подходит для лабораторий с нагрузкой до 50-100 образцов в неделю.
Может ли TapeStation заменить обычный гель-электрофорез?
Для аналитических задач - да. TapeStation даёт количественную информацию (концентрация, размер, целостность), которую трудно получить из обычного геля. Для препаративных задач (выделение полосы из геля, клонирование) TapeStation не подходит - необходим классический агарозный гель с последующей вырезкой фрагмента. Стоимость за анализ на TapeStation выше, чем на агарозном геле.
Какой тип ScreenTape нужен для NGS-библиотек?
Для стандартных NGS-библиотек (150-500 п.н.) используется D1000 ScreenTape (диапазон 35-1000 п.н.). Для библиотек с длинными вставками - D5000 (100-5000 п.н.). Для образцов с очень низкой концентрацией - High Sensitivity D5000 (чувствительность от 5 пг/мкл). Выбор зависит от типа библиотеки и ожидаемого диапазона размеров.
Сколько стоит один анализ на TapeStation?
Стоимость зависит от типа ScreenTape и региона. Ориентировочно один анализ обходится в несколько сотен рублей (картридж на 16 анализов). Это дороже, чем агарозный гель, но значительно дешевле альтернативных автоматизированных систем. Экономия времени оператора и воспроизводимость результатов компенсируют стоимость расходных материалов.
Дополнительные материалы
Коды для госзакупок
Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.
Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.
Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.