Luminex FlowSight
Компактный визуализирующий проточный цитометр начального уровня. 1-2 лазера (488, 642 нм), до 12 каналов визуализации, объектив 20x. Упрощенная и более доступная версия ImageStreamX для задач, где визуальная верификация дополняет стандартную цитометрию. Программное обеспечение IDEAS.
ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.
Ключевые характеристики
| Тип | Компактный визуализирующий (imaging) проточный цитометр |
| Лазеры | 1-2: 488 нм (синий); опционально 642 нм (красный) |
| Детектор | TDI CCD-камера |
| Объектив | 20x |
| Размещение | Компактный настольный, стандартный лабораторный стол |
| Разрешение | ~1 мкм/пиксель |
| Объем данных | 0,5-3 ГБ на эксперимент |
| Формат данных | .rif, .cif, .daf (собственный), экспорт статистик |
| Скорость анализа | До 2 000-5 000 объектов/сек |
| Каналы визуализации | До 12 (флуоресценция + светлое поле + рассеяние) |
| Программное обеспечение | IDEAS (Image Data Exploration and Analysis Software) |
| Морфометрические функции | Площадь, округлость, текстура, базовая колокализация |
Описание
Назначение
Luminex FlowSight - компактный визуализирующий (imaging) проточный цитометр производства Amnis/Luminex (ныне Cytek Biosciences). Прибор является младшей моделью в линейке визуализирующих цитометров Amnis и представляет собой доступную точку входа в технологию imaging flow cytometry.
Место в линейке
FlowSight занимает начальную позицию в линейке Amnis. Старшая модель ImageStreamX Mk II предлагает до 5 лазеров и объективы 20x/40x/60x.
FlowSight спроектирован для лабораторий, которым необходима визуальная верификация цитометрических данных, но не требуется субклеточное разрешение и глубокий морфометрический анализ.
Принцип работы
Как и ImageStreamX, FlowSight получает многоканальные изображения каждой клетки, проходящей через проточную ячейку. Объектив 20x даёт разрешение около 1 мкм/пиксель, достаточное для визуализации морфологии клетки в целом и детекции крупных внутриклеточных структур.
TDI CCD-детектор даёт высокое соотношение сигнал/шум при коротких экспозициях. Призменная спектральная декомпозиция разделяет излучение на 12 каналов.
Позиция на рынке
FlowSight позиционируется как наиболее доступная платформа визуализирующей цитометрии. Прибор использует то же ПО IDEAS, что и ImageStreamX, что даёт совместимость данных и навыков.
Основные конкуренты (Attune CytPix, BD FACSDiscover S8) предлагают визуализацию как дополнение к стандартной цитометрии, тогда как FlowSight - прежде всего визуализирующий прибор.
Ключевые технологии
Визуализирующая оптика 20x
Объектив 20x даёт разрешение около 1 мкм/пиксель. Этого достаточно для визуализации морфологии клетки, различения типов клеток по форме и размеру, детекции фагосом и ядер.
Субклеточная детализация (визуализация гранул, кольцевых структур, ядерная транслокация отдельных факторов) на 20x существенно ограничена по сравнению с 40x/60x объективами ImageStreamX.
TDI CCD-детектор
FlowSight использует CCD-камеру с технологией Time Delay Integration, аналогичную старшей модели. TDI синхронизирует считывание пикселей со скоростью движения клетки через поле зрения.
Высокое соотношение сигнал/шум при коротких экспозициях критически важно для потоковой визуализации.
Лазерная система
| Лазер | Длина волны | Основные красители |
|---|---|---|
| Синий | 488 нм | FITC, PE, PerCP, PE-Cy5, PE-Cy7 |
| Красный | 642 нм (опция) | APC, APC-Cy7 |
Отсутствие фиолетового лазера 405 нм исключает использование DAPI, Hoechst, BV421 и других UV/фиолетовых красителей. Для окрашивания ядер необходимо использовать красители, совместимые с 488 нм (SYTO-серия) или 642 нм (DRAQ5).
12 каналов визуализации
Призменная декомпозиция разделяет излучение на 12 каналов. Часть каналов отведена под светлое поле (brightfield) и рассеянный свет (scatter), остальные - под флуоресценцию.
Реальное число доступных флуоресцентных каналов определяется числом лазеров (1 или 2).
Программное обеспечение IDEAS
FlowSight использует то же ПО IDEAS, что и ImageStreamX Mk II. Доступен полный набор морфометрических features: площадь, периметр, округлость, яркость, текстура, градиент.
Однако при работе с данными 20x-объектива многие тонкие features (ядерная транслокация, субклеточная колокализация) дают менее информативные результаты.
Для кого подходит
- Лаборатории, начинающие работу с imaging flow cytometry - освоение технологии и ПО IDEAS без масштабных инвестиций
- Контроль качества гейтирования - визуальная верификация сингулетов, дублетов и дебриса
- Базовый анализ фагоцитоза - визуализация поглощенных частиц внутри макрофагов, нейтрофилов, дендритных клеток
- Анализ апоптоза с морфологической верификацией - различение раннего и позднего апоптоза по морфологии ядра и мембраны
- Гематология - морфологическая классификация лейкоцитов, детекция аномальных клеток
- Учебные лаборатории - обучение концепциям визуализирующей цитометрии студентов и аспирантов
- Лаборатории с ограниченным бюджетом - получение визуальных данных без стоимости ImageStreamX
Особенности эксплуатации
ПО
IDEAS - единая платформа для всех визуализирующих цитометров Amnis/Cytek (FlowSight, ImageStreamX). Включает построение гистограмм и скаттерограмм, визуализацию галерей, морфометрию и экспорт.
Формат данных - собственный (.rif, .cif, .daf), с экспортом статистик. Полная совместимость данных между FlowSight и ImageStreamX.
Установка
- Форм-фактор: компактный настольный
- Виброизоляция не требуется
- Стандартный лабораторный стол, стандартная электросеть
- Уровень шума и масса значительно ниже, чем у ImageStreamX
Обслуживание
Расходные материалы: обжимающая жидкость, калибровочные бисы (SpeedBeads), промывочные растворы. Стоимость расходных материалов умеренная.
Типичный файл данных составляет 0,5-3 ГБ на эксперимент. Рекомендуется компьютер с 32+ ГБ RAM и SSD-хранилищем.
Обучение
Освоение IDEAS на FlowSight проще, чем на ImageStreamX, за счёт меньшего числа лазеров и более простым данным. Базовый курс - 2-3 дня.
Навыки работы в IDEAS полностью переносятся на ImageStreamX при последующем переходе.
Ограничения
- Единственный объектив 20x: для ядерной транслокации, детализированной колокализации, микроядерного теста недостаточен
- Отсутствие фиолетового лазера: DAPI и Hoechst недоступны
- Скорость анализа (до 5 000 объектов/сек) ниже, чем у стандартных цитометров
- Невозможно обновить до ImageStreamX - это различные приборы с разной архитектурой
Области применения
Сравнение с аналогами
ImageStreamX Mk II - старшая модель той же линейки Amnis. До 5 лазеров (против 1-2 у FlowSight), объективы 20x/40x/60x (против только 20x), разрешение до 0,3 мкм/пиксель (против 1 мкм). ImageStreamX даёт субклеточное разрешение для ядерной транслокации и детализированной колокализации. FlowSight - более доступный и компактный прибор для задач клеточного уровня.
Attune CytPix - классический проточный цитометр с добавленной функцией визуализации (brightfield + 1-2 FL-канала). Значительно превосходит FlowSight по скорости (до 35 000 событий/сек), числу лазеров (до 4) и числу параметров (до 16 FL). По возможностям визуализации CytPix уступает FlowSight: меньше каналов изображений, нет морфометрического анализа в IDEAS. CytPix - прежде всего цитометр с бонусной визуализацией, FlowSight - прежде всего визуализирующий прибор.
Стандартные анализаторы не получают изображений клеток: регистрируют только интегральные интенсивности. Скорость анализа (20 000-25 000 событий/сек) и объем данных значительно меньше. Если визуализация не требуется, стандартный анализатор обеспечит более высокую пропускную способность и простоту работы.
Частые вопросы
Достаточно ли разрешения FlowSight (20x) для анализа ядерной транслокации?
Для большинства задач ядерной транслокации разрешения объектива 20x (~1 мкм/пиксель) недостаточно. Количественная оценка перемещения транскрипционных факторов из цитоплазмы в ядро требует четкого разрешения границы ядра. На 20x граница ядра визуализируется лишь приблизительно, что приводит к высокому уровню шума при расчете Nuclear Translocation Score. Для таких задач необходим ImageStreamX Mk II с объективом 40x или 60x.
Можно ли обновить FlowSight до полной версии ImageStreamX?
Нет. FlowSight и ImageStreamX Mk II - это различные приборы с разной оптической и механической архитектурой. Невозможно установить объективы 40x/60x на FlowSight или добавить дополнительные лазеры сверх предусмотренных конфигураций. Данные FlowSight и ImageStreamX полностью совместимы на уровне IDEAS, что упрощает переход между платформами.
Как FlowSight соотносится со стандартными цитометрами по цене и пропускной способности?
FlowSight стоит значительно дороже базовых двухлазерных анализаторов (BD Accuri C6 Plus, MACSQuant Analyzer 10) и сопоставим по цене с трехлазерными исследовательскими анализаторами. Скорость анализа (до 5 000 объектов/сек) ниже, чем у стандартных цитометров (20 000-50 000 событий/сек). FlowSight оправдан только при наличии конкретных задач, требующих визуальной информации.
Дополнительные материалы
Коды для госзакупок
Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.
Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.
Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.