MGI DNBSEQ-G99
Универсальный настольный секвенатор среднего класса на технологии DNBSEQ. Выход до 72 Гб за запуск, до 480 млн ридов, длина до PE150. Поддерживает несколько типов проточных ячеек для гибкого масштабирования от таргетных панелей до малых геномных проектов.
ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.
Ключевые характеристики
| Тип | Настольный секвенатор среднего класса |
| Форм-фактор | Настольный |
| Время запуска | 12-48 ч (в зависимости от режима и проточной ячейки) |
| Формат данных | FASTQ |
| Длина ридов (макс) | PE150 |
| Парный конец (paired-end) | Да |
| Точность чтения (Q30+) | 85%+ |
| Мультиплексирование | Да (стандартные индексы MGI) |
| Проточные ячейки/чипы | Несколько типов проточных ячеек (FCS/FCM/FCL) |
| Выход данных за запуск | До 72 Гб |
| Программное обеспечение | MegaBOLT, ZTRON |
| Количество ридов за запуск | До 480 млн |
| Технология секвенирования | DNBSEQ (DNA Nanoballs + cPAS) |
Описание
Назначение
MGI DNBSEQ-G99 является универсальным настольным секвенатором среднего класса. Прибор разработан для исследовательских и клинических лабораторий, которым необходима гибкость объёмов секвенирования без перехода к продакшн-системам.
Место в линейке
DNBSEQ-G99 занимает позицию между начальным DNBSEQ-E25 и высокопроизводительным DNBSEQ-G400. Ключевое преимущество G99 перед младшей моделью: поддержка нескольких типов проточных ячеек разной ёмкости, что даёт возможность оптимизировать стоимость запуска под конкретную задачу.
Прямой конкурент в экосистеме Illumina - NextSeq 550/1000/2000. G99 предлагает сопоставимый выход данных при более низкой стоимости секвенирования за гигабайт, что обусловлено эффективностью технологии ДНК-наношаров и отсутствием лицензионных наценок на реагенты.
Принцип работы
G99 использует технологию DNBSEQ, общую для всей линейки MGI. Линейные библиотеки циркуляризуются и амплифицируются методом катящегося кольца (RCA) в компактные ДНК-наношары. Наношары загружаются на паттернированные проточные ячейки с упорядоченной решёткой нанолунок.
Секвенирование выполняется методом cPAS (combinatorial Probe-Anchor Synthesis). Якорный праймер связывается с наношаром, после чего флуоресцентно меченые зонды последовательно определяют каждый нуклеотид. Упорядоченное расположение наношаров повышает плотность данных и снижает оптические ошибки по сравнению со стохастическим кластерогенезом.
Позиция на рынке
G99 конкурирует с линейкой Illumina NextSeq, предлагая сопоставимую производительность при более демократичной стоимости владения. Поддержка проточных ячеек разной ёмкости (от компактных до полноразмерных) решает проблему избыточной мощности, характерную для секвенаторов фиксированной конфигурации.
Прибор востребован в геномных лабораториях средней загрузки, клинических центрах молекулярной диагностики и биотехнологических компаниях. Возможность запуска с малым числом образцов без значительного удорожания делает G99 удобным для лабораторий с непостоянным потоком проб.
Области применения
Сравнение с аналогами
NextSeq 2000 предлагает до 360 Гб за запуск (P3 flow cell) и поддерживает длину ридов до PE300, значительно превосходя G99 по максимальному выходу. Однако NextSeq 2000 дороже как по стоимости прибора, так и по реагентам. G99 оптимален для лабораторий с умеренными объёмами, где важна стоимость за гигабайт.
NextSeq 550 даёт до 120 Гб (High Output) и до 400 млн ридов. Прибор является более старой платформой с устоявшейся методической базой. G99 предлагает сопоставимую производительность при существенно более низкой стоимости расходных материалов и более современной оптической системе.
DNBSEQ-G400 даёт до 1440 Гб за запуск и до 1800 млн ридов, что на порядок больше G99. G400 поддерживает длину ридов до PE400 и оснащён двумя слотами для проточных ячеек. G99 дешевле в эксплуатации при малых и средних объёмах, где мощность G400 избыточна.
Частые вопросы
Чем DNBSEQ-G99 отличается от Illumina NextSeq 2000?
Оба прибора занимают нишу настольных секвенаторов среднего класса с выходом до нескольких десятков гигабайт. G99 использует технологию ДНК-наношаров, с более низким уровнем дупликации ридов. NextSeq 2000 предлагает более высокий максимальный выход (до 360 Гб в режиме P3) и поддержку ридов до PE300 для ряда применений. Стоимость реагентов MGI, как правило, ниже.
Можно ли секвенировать полный геном человека на G99?
G99 способен генерировать до 72 Гб за запуск, что достаточно для WGS человека с низким покрытием (5-10x). Для стандартного клинического покрытия 30x (около 90 Гб) потребуется несколько запусков или объединение данных. Для рутинного WGS подходят DNBSEQ-G400 или DNBSEQ-T7.
Какие типы проточных ячеек поддерживает G99?
G99 работает с несколькими типами проточных ячеек различной ёмкости: от компактных (FCS) для малых проектов до полноразмерных (FCL) для максимального выхода данных. Это даёт возможность оптимизировать стоимость запуска под объём задачи и избежать пустого расходования ёмкости при малом числе образцов.
Дополнительные материалы
Коды для госзакупок
Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.
Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.
Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.