MGI Tech (BGI Group)

MGI DNBSEQ-T7

Страна: Китай

Продакшн-секвенатор ультравысокой производительности на технологии DNBSEQ. Выход до 6000 Гб за запуск, до 5000 млн ридов, четыре независимых проточных ячейки. Предназначен для крупных геномных центров и популяционных проектов.

ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.

Ключевые характеристики

Тип Продакшн-секвенатор ультравысокой производительности
Форм-фактор Напольный (продакшн-класс)
Время запуска 24 ч (PE150 на одну проточную ячейку)
Формат данных FASTQ
Длина ридов (макс) PE150
Парный конец (paired-end) Да
Точность чтения (Q30+) 85%+
Мультиплексирование Да (стандартные индексы MGI, глубокое мультиплексирование)
Проточные ячейки/чипы 4 независимых слота для проточных ячеек
Выход данных за запуск До 6000 Гб (4 проточные ячейки)
Программное обеспечение MegaBOLT, ZTRON
Количество ридов за запуск До 5000 млн
Технология секвенирования DNBSEQ (DNA Nanoballs + cPAS)

Описание

Назначение

MGI DNBSEQ-T7 является продакшн-секвенатором ультравысокой производительности. Прибор разработан для геномных центров, работающих с потоком тысяч образцов в месяц, и является ответом MGI на Illumina NovaSeq 6000.

Место в линейке

DNBSEQ-T7 занимает позицию флагманской системы для массового секвенирования. Четыре независимых слота для проточных ячеек дают суммарный выход до 6000 Гб за полную загрузку. Прибор расположен над DNBSEQ-G400 и ниже DNBSEQ-T20x2, который удваивает производительность за счёт двухмодульной архитектуры.

В прямом сравнении с Illumina NovaSeq 6000, T7 даёт сопоставимый максимальный выход (6000 Гб) при значительно более низкой стоимости секвенирования за геном. По данным крупных геномных проектов (включая BGI), стоимость WGS 30x на T7 достигает уровня ниже 100 долларов.

Принцип работы

T7 использует технологию DNBSEQ с масштабированной оптической системой. ДНК-наношары формируются стандартным методом катящегося кольца (RCA) из циркуляризованных библиотек и загружаются на паттернированные проточные ячейки большого формата.

Считывание выполняется методом cPAS с использованием высокоскоростной камеры и оптимизированной оптики. Четыре проточных ячейки работают полностью независимо: каждая может быть загружена, запущена и выгружена отдельно от остальных.

Масштабирование производительности достигнуто за счёт увеличения размера проточных ячеек и оптимизации плотности нанолунок. Каждая проточная ячейка содержит до нескольких миллиардов позиций для наношаров.

Позиция на рынке

T7 стал основным инструментом в проектах популяционной геномики, включая крупнейшие национальные программы секвенирования. Стоимость WGS 30x ниже 100 долларов сделала полногеномное секвенирование экономически доступным для больших когорт.

Прибор востребован в национальных геномных центрах, крупных сервисных лабораториях, фармацевтических компаниях (клинические исследования) и агрогеномных проектах. T7 также используется в исследовательских институтах с разнообразным портфелем геномных проектов за счёт четырёх независимых слотов.

Области применения

Полногеномное секвенирование (WGS) в масштабах популяций Крупные когортные геномные исследования Клинические исследования в фармацевтике (companion diagnostics) Секвенирование полного экзома (WES) в высокопроизводительном потоке Масштабная транскриптомика (тысячи образцов RNA-Seq) Пренатальный скрининг (НИПТ) в национальном масштабе Агрогеномика (секвенирование сельскохозяйственных культур и пород) Метагеномные проекты с большими когортами (кишечный микробиом, экология)

Сравнение с аналогами

Illumina NovaSeq 6000 Illumina

NovaSeq 6000 даёт до 6000 Гб (S4 flow cell, 2 штуки), что совпадает с максимумом T7. NovaSeq 6000 поддерживает длину ридов до PE250 против PE150 у T7. Ключевое преимущество T7: существенно более низкая стоимость секвенирования за гигабайт. NovaSeq 6000 имеет более обширную экосистему совместимых реагентов и протоколов.

Illumina NovaSeq X Plus Illumina

NovaSeq X Plus является новейшей продакшн-платформой Illumina с выходом до 16 000 Гб (25B flow cell). По максимальной производительности X Plus значительно превосходит T7. Прямым конкурентом X Plus в линейке MGI является DNBSEQ-T20x2. T7 выигрывает по стоимости владения в лабораториях, где выход 6000 Гб за запуск достаточен.

MGI DNBSEQ-T20x2 MGI Tech (BGI Group)

DNBSEQ-T20x2 является развитием платформы T7 с удвоенной производительностью (до 10 000+ Гб). T20x2 использует более современную оптику и флуидику. T7 остаётся актуальным для центров, где текущий объём секвенирования не требует производительности T20x2 и важна проверенная стабильность платформы.

Частые вопросы

Зачем T7 четыре независимых проточных ячейки?

Четыре слота — непрерывный конвейер секвенирования. Пока одна проточная ячейка завершает прогон, другая загружается, третья секвенируется, четвёртая выгружается. Это минимизирует простой прибора — разные проекты обрабатываются параллельно. Суммарный выход при полной загрузке достигает 6000 Гб.

Как T7 соотносится с Illumina NovaSeq 6000 по стоимости?

Оба прибора дают сопоставимый максимальный выход (около 6000 Гб). Однако стоимость секвенирования за гигабайт на T7 существенно ниже за счёт более доступных реагентов MGI. В крупных проектах разница в стоимости реагентов накапливается и может составлять десятки процентов от бюджета.

Какие требования к инфраструктуре предъявляет T7?

T7 является напольным прибором продакшн-класса. Требуются выделенное помещение с контролем температуры (18-28 C) и влажности, стабильное электроснабжение и высокоскоростная сеть для передачи данных. Один запуск PE150 на четырёх проточных ячейках генерирует до 6 ТБ данных, что требует соответствующей серверной и хранилищной инфраструктуры.

Дополнительные материалы

Коды для госзакупок

Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.

26.51.53.190
Приборы и аппаратура для физического или химического анализа прочие
Основной код для секвенаторов как приборов генетического анализа
26.60.12.119
Аппараты электродиагностические прочие
Закупка для клинико-генетических и онкологических лабораторий (ИВД)
26.51.66.190
Приборы для измерения или контроля прочие, не включённые в другие группировки
Универсальный код при закупке в составе геномного центра
32.50.50.190
Изделия медицинские прочие, не включённые в другие группировки
Закупка секвенатора как медицинского изделия для клинической геномики
28.99.39.190
Оборудование специального назначения прочее, не включённое в другие группировки
Закупка для исследовательских геномных и биоинформатических лабораторий
Почему мы не указываем коды КТРУ?

Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.

Отказ от ответственности

Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.

Найти актуальные коды КТРУ в ЕИС (предзаполненный поиск)