QIAGEN

QIAGEN QIAcuity

Страна: Германия

Интегрированная система цифровой ПЦР на наноплейтах: разделение + амплификация + визуализация в одном приборе за ~2 часа. Модели One (1 планшет), Four (4), Eight (8, до 1 248 образцов/день). До 5 каналов, 8 500 или 26 000 партиций на лунку. IVD-версия QIAcuityDx.

ООО «Спин Аналитика» не осуществляет продажу оборудования. Платформа является информационно-навигационным сервисом.

Ключевые характеристики

ПО QIAcuity Software Suite 3.2 (серверная, браузерная, 21 CFR Part 11)
Вес ~100 кг (QIAcuity One)
Тип Цифровая ПЦР на наноплейтах (интегрированная)
Модели QIAcuity One (2/5-plex), Four (5-plex), Eight (5-plex), Dx (IVD)
IVD-версия QIAcuityDx (на базе QIAcuity Four)
Мультиплекс До 5 мишеней (до 12 с LSS Software v3.1+)
Объём реакции 12 мкл (8.5K) или 40 мкл (26K)
Производитель QIAGEN, Германия
Рабочий процесс Интегрированный (разделение + ПЦР + визуализация в одном приборе)
Габариты (Ш x Г x В) 600 x 700 x 600 мм (QIAcuity One)
Партиций на лунку 8 500 (наноплейт 8.5K) или 26 000 (наноплейт 26K)
Время до результата ~2 часа (первый планшет)
Форматы наноплейтов 8-well, 24-well, 96-well
Каналы флуоресценции 2 (One 2-plex) или 5 (Green, Yellow, Orange, Red, Crimson)
Объём одной партиции (26K) 0,91 нл
Макс. пропускная способность 1 248 образцов/день (QIAcuity Eight, 96-well наноплейт)

Описание

Назначение

QIAGEN QIAcuity - платформа цифровой ПЦР (dPCR) на основе микрофлюидных наноплейтов. Все три этапа dPCR - разделение образца на партиции, термоциклирование и флуоресцентная визуализация - выполняются в одном приборе. Результат - за ~2 часа, hands-on время ~15 минут.

Основное отличие от капельных систем (Bio-Rad ddPCR): партиции формируются в фиксированных микрокамерах наноплейта (не в каплях эмульсии). Размер камер постоянный, нет слияния капель, нет отдельного генератора.

Обзор линейки

Модель Планшетов одновременно Каналы Термоциклер Образцов/день (96-well) Для кого
QIAcuity One (2-plex) 1 2 (Green, Yellow) 1 До 384 Начальный уровень
QIAcuity One (5-plex) 1 5 1 До 384 Базовый мультиплекс
QIAcuity Four 4 5 1 До 672 Средняя пропускная способность
QIAcuity Eight 8 5 2 До 1 248 Максимальная пропускная способность
QIAcuityDx 4 5 1 - Клиническая диагностика (IVD)

Принцип работы

  1. Реакционная смесь пипетируется в лунки наноплейта (как в обычный qPCR-планшет)
  2. Наноплейт запечатывается резиновой пленкой и загружается в прибор
  3. Прибор автоматически: разделяет образец на 8 500 или 26 000 микрокамер давлением, выполняет ПЦР, визуализирует все партиции флуоресцентным сканером
  4. ПО рассчитывает абсолютную концентрацию по статистике Пуассона

Позиция на рынке

QIAcuity - самая высокопроизводительная dPCR-платформа на рынке (до 1 248 образцов/день с QIAcuity Eight). Основное преимущество перед капельными системами - интегрированный рабочий процесс (всё в одном) и минимальное hands-on время. Основные конкуренты: Bio-Rad QX600/QX ONE (ddPCR), Stilla Naica, Thermo QuantStudio Absolute Q.

Ключевые технологии

Наноплейты с фиксированными микрокамерами

Главное отличие от капельных систем. Микрокамеры (партиции) формованы в структуре наноплейта - их размер и объём фиксированы. Преимущества:

  • Нет вариабельности размера (в отличие от капель)
  • Нет слияния и распада партиций
  • Нет отдельного этапа генерации капель
  • Запечатанные наноплейты предотвращают контаминацию и испарение
  • Обращение с наноплейтами аналогично qPCR-планшетам - знакомый рабочий процесс

Доступные форматы:

Наноплейт Лунок Партиций/лунка Объём реакции Применение
26K 24-well 24 ~26 000 40 мкл Редкие мутации, жидкостная биопсия
26K 8-well 8 ~26 000 40 мкл Макс. чувствительность, редкие события
8.5K 24-well 24 ~8 500 12 мкл CNV, библиотеки NGS
8.5K 96-well 96 ~8 500 12 мкл Высокая пропускная способность

Объём одной партиции (26K): 0,91 нл.

Интегрированный рабочий процесс

Весь процесс в одном приборе: разделение (давлением) -> термоциклирование -> флуоресцентная визуализация. Время от загрузки до результата: ~2 часа. Hands-on: ~15 минут. Не требуется отдельный генератор капель, термоциклер или ридер.

5 каналов флуоресценции

Канал Краситель Применение
Green FAM Основной канал
Yellow VIC, HEX Второй мишень / генотипирование
Orange TAMRA Мультиплекс
Red ROX Мультиплекс
Crimson Cy5 Мультиплекс

С ПО QIAcuity Suite v3.1+ и технологией LSS (Level of Signal Separation) возможен мультиплекс до 12 мишеней на 5 каналах за счёт компенсации перекрёстных помех.

Volume Precision Factor (VPF)

96 индивидуальных поправочных коэффициентов (по одному на позицию лунки) компенсируют производственную вариабельность объёма партиций. Снижает CV с ~2,9% до ~1,3%.

Hyperwell Analysis

Объединение данных из нескольких лунок в один виртуальный "гипервелл" с суммарным числом партиций. Для детекции сверхредких событий, когда объём образца превышает ёмкость одной лунки.

Для кого подходит

  • Онкологические лаборатории - QIAcuity Four/Eight: жидкостная биопсия, MRD, наноплейт 26K для макс. чувствительности
  • Лаборатории NGS - наноплейт 8.5K 96-well: высокопроизводительная квантификация библиотек
  • Генная терапия - характеризация векторов, число копий, остаточная ДНК
  • Клинические лаборатории - QIAcuityDx: IVD-сертификация, интегрированный рабочий процесс
  • Лаборатории с высокой загрузкой - QIAcuity Eight: до 1 248 образцов/день
  • Начинающие в dPCR - QIAcuity One: простой переход от qPCR (знакомое обращение с планшетами)
  • Экологический мониторинг - детекция патогенов в сточных водах
  • Безопасность пищевых продуктов - детекция ГМО, патогенов

Особенности эксплуатации

Как выбрать модель

  1. Объём задач:

    • До 384 образцов/день -> QIAcuity One
    • 400-700 образцов/день -> QIAcuity Four
    • Более 700 образцов/день -> QIAcuity Eight
  2. Число каналов:

    • 2 канала достаточно -> QIAcuity One 2-plex (дешевле)
    • Мультиплекс 3-5 мишеней -> 5-plex версии
  3. Чувствительность:

    • Стандартная (CNV, библиотеки) -> наноплейт 8.5K
    • Максимальная (редкие мутации, ctDNA) -> наноплейт 26K
  4. IVD:

    • Да -> QIAcuityDx

Программное обеспечение

QIAcuity Software Suite (текущая версия 3.2):

  • Серверная архитектура: доступ через браузер с любого компьютера в сети
  • Абсолютная количественная оценка, детекция мутаций, CNV, экспрессия генов
  • 1D/2D-скатерплоты, тепловые карты, карты сигналов
  • Мультиплекс до 12 мишеней (LSS, v3.1+)
  • 21 CFR Part 11: аудит-трейл, электронные подписи, ролевая модель

Реагенты

  • QIAcuity Probe PCR Kit (зонды TaqMan)
  • QIAcuity EG PCR Kit (EvaGreen)
  • QIAcuity OneStep Advanced Probe Kit (RT-dPCR для РНК)
  • QIAcuity High Multiplex PCR Kit (12-plex)
  • Готовые ассеи на GeneGlobe (CNV, мутации, микроРНК, бактерии, вирусы)

Ограничения

  • Вес ~100 кг (QIAcuity One) - требуется прочный лабораторный стол
  • Специальные наноплейты (не стандартные планшеты)
  • 5 каналов (vs 6 у Bio-Rad QX600)
  • 26 000 партиций максимум (vs ~20 000 у Bio-Rad, но с большим объёмом реакции)
  • Стоимость наноплейтов - значительная статья расходов
  • QIAcuity One 2-plex ограничен двумя каналами

Области применения

Жидкостная биопсия (ctDNA) - детекция редких мутаций (наноплейт 26K) Мониторинг остаточной болезни (MRD) в онкологии Количественная оценка библиотек NGS (наноплейт 8.5K 96-well) Анализ вариации числа копий (CNV) Количественная оценка генного редактирования (CRISPR) Характеризация векторов генной терапии Детекция патогенов в сточных водах и окружающей среде Детекция ГМО и безопасность пищевых продуктов Вирусная нагрузка (RT-dPCR с OneStep Kit) Клиническая диагностика (QIAcuityDx, IVD)

Сравнение с аналогами

Bio-Rad QX600 ddPCR Bio-Rad Laboratories

QX600 - капельная dPCR (6 каналов, до 12 мишеней), требует отдельный генератор, термоциклер и ридер, время 4-5 часов. QIAcuity - наноплейтовая dPCR (5 каналов, до 12 с LSS), всё в одном приборе, ~2 часа. QIAcuity выигрывает простотой и пропускной способностью (1 248 обр./день). QX600 выигрывает большей установленной базой и количеством каналов.

Stilla Naica (6-цветная) Stilla Technologies

Naica - кристаллическая dPCR с 6 каналами и полуинтегрированным рабочим процессом. QIAcuity предлагает значительно более высокую пропускную способность (до 1 248 vs ~100 образцов/день), большее разнообразие форматов наноплейтов (8/24/96 лунок) и IVD-версию. Naica выигрывает количеством каналов (6 vs 5) и числом партиций (~30 000 vs 26 000).

Thermo Fisher QuantStudio Absolute Q Thermo Fisher Scientific

Absolute Q - компактная интегрированная система (MAP-технология, 5 каналов, ~90 мин до результата, 16 образцов на планшет). QIAcuity значительно превосходит по пропускной способности (до 1 248 vs ~100 образцов/день) и гибкости форматов (8/24/96 лунок). Absolute Q выигрывает скоростью (90 мин vs 2 ч) и компактностью.

Частые вопросы

Чем наноплейты лучше капельной технологии (ddPCR)?

Наноплейты имеют фиксированные микрокамеры (партиции) - нет вариабельности размера, нет слияния капель, нет отдельного этапа генерации. Весь процесс (разделение + ПЦР + чтение) в одном приборе за ~2 часа. Капельные системы (Bio-Rad) требуют отдельный генератор, термоциклер и ридер, общее время 4-5 часов. Наноплейты проще в использовании (как qPCR-планшеты).

Как выбрать между наноплейтами 8.5K и 26K?

8.5K (8 500 партиций, 12 мкл): для задач со средней чувствительностью - CNV, квантификация библиотек NGS, генная экспрессия. 26K (26 000 партиций, 40 мкл): для максимальной чувствительности - редкие мутации (ctDNA), жидкостная биопсия, MRD. 26K анализирует больший объём образца, что критично для детекции сверхредких мишеней.

Можно ли использовать стандартные qPCR-планшеты?

Нет. QIAcuity требует специальные наноплейты с микрофлюидной структурой. Однако обращение с наноплейтами аналогично qPCR-планшетам: пипетирование в лунки, запечатывание плёнкой, загрузка в прибор. Переход от qPCR к dPCR минимально меняет рабочий процесс.

Как QIAcuity сравнивается с Bio-Rad QX600?

QX600 превосходит по числу каналов (6 vs 5) и может детектировать до 12 мишеней через амплитудное мультиплексирование. QIAcuity выигрывает интегрированным рабочим процессом (всё в одном vs 4 прибора), скоростью (~2 ч vs 4-5 ч) и пропускной способностью (до 1 248 образцов/день). Выбор зависит от приоритета: максимальный мультиплекс (QX600) или максимальная простота и пропускная способность (QIAcuity).

Что такое QIAcuityDx?

IVD-сертифицированная версия на базе QIAcuity Four (4 планшета одновременно, 5 каналов). Предназначена для клинической молекулярной диагностики: онкология (жидкостная биопсия, MRD), инфекционные заболевания. Интегрированный рабочий процесс снижает риск контаминации. Специальные наноплейты и реагенты для IVD.

Коды для госзакупок

Возможные коды ОКПД2 для закупки данного оборудования по 44-ФЗ и 223-ФЗ. Выбор кода зависит от назначения и контекста закупки.

26.51.53.190
Приборы и аппаратура для физического или химического анализа прочие
Основной код для амплификаторов и ПЦР-систем как приборов молекулярного анализа
26.60.12.119
Аппараты электродиагностические прочие
Закупка для клинико-диагностических лабораторий (ИВД, ПЦР-диагностика)
26.51.66.190
Приборы для измерения или контроля прочие, не включённые в другие группировки
Универсальный код при закупке в составе молекулярно-биологического комплекса
28.99.39.190
Оборудование специального назначения прочее, не включённое в другие группировки
Закупка для исследовательских, криминалистических и ветеринарных лабораторий
32.99.53.131
Оборудование учебное лабораторное
Закупка для оснащения учебных молекулярно-биологических лабораторий
Почему мы не указываем коды КТРУ?

Коды КТРУ регулярно обновляются Минфином и зависят от конкретных характеристик закупаемого оборудования (автоматическое/полуавтоматическое, с охлаждением/без и т.д.). Актуальные коды КТРУ доступны только в Единой информационной системе закупок.

Отказ от ответственности

Информация о кодах ОКПД2 носит справочный характер. Коды приведены в качестве примера возможных вариантов классификации данного оборудования. Выбор кода, его соответствие нормативно-правовым актам и целесообразность применения определяются заказчиком самостоятельно. ООО «Спин Аналитика» не несёт ответственности за некорректное применение указанных кодов при осуществлении закупочных процедур.

Найти актуальные коды КТРУ в ЕИС (предзаполненный поиск)